Địa Lý Toàn Thư sẽ lý giải thuật phong thủy dưới ánh sáng của chủ nghĩa duy vật lịch sử, với tinh thần gạn đục, khơi trong nhằm chấn hưng văn hóa dân tộc. Trong từng đoạn đều có sự chú thích, bình giải theo tinh thần khoa học. Sách được chia làm 3 phần:
- Phong thủy là gì? Gồm các vấn đề sau: Khái niệm về thuật phong thủy, thuật phong thuỷ ở một số quốc gia đang phát triển, thuật phong thủy với vấn đề đất đai, thuật phong thuỷ với ngoại cảnh thiên nhiên...
- Chọn hướng xây nhà theo thuật phong thủy, kinh dịch và bát quái đồ, kiến thức cơ bản chuyên dụng trong kinh dịch và thuật phong thủy...
- Gồm các phần: Khái quát, Khảm quái, Cấn quái, Chấn quái, Tốn quái, Ly quái, Đoài quái đối với con người và vũ trụ.
Ngoài ra sách còn có phần cấu trúc và cách sử dụng Bát quái đồ để trang trí nội thất và thước lỗ ban.